Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms