Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U595 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U595 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U595 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U595 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U595 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U595 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U595 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U595 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U595 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U595 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U595 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U595 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U595 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U595 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U595 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U595 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3U595 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U595 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U595 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U595 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U595 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U595 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U595 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U595 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U595 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U595 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U595 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U595 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U595 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U595 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U595 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U595 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U595 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3U595 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U595 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U595 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U595 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U595 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U595 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U595 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U595 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U595 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U595 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U595 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U595 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U595 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U595 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U595 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U595 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3U595 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U595 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U595 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U595 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U595 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U595 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U595 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U595 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U595 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U595 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U595 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U595 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U595 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U595 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U595 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U595 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3U595 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3U595 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3U595 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3U595 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3U595 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3U595 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3U595 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3U595 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3U595 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3U595 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3U595 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3U595 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3U595 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3U595 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3U595 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3U595 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3U595 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3U595 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3U595 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3U595 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3U595 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3U595 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3U595 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3U595 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3U595 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3U595 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3U595 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3U595 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3U595 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3U595 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3U595 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3U595 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3U595 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3U595 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms