Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hvcn1Q3U2S8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hvcn1Q3U2S8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hvcn1Q3U2S8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms