Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms