Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
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UBE4AQ14139 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBE4AQ14139 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE4AQ14139 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
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