Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE4BQ07343 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms