Protein–RNA interactions for Protein: Q05315

CLC, Galectin-10, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCQ05315 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLCQ05315 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLCQ05315 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLCQ05315 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLCQ05315 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLCQ05315 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLCQ05315 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLCQ05315 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLCQ05315 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLCQ05315 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLCQ05315 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLCQ05315 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLCQ05315 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLCQ05315 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLCQ05315 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLCQ05315 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLCQ05315 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CLCQ05315 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLCQ05315 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLCQ05315 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLCQ05315 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLCQ05315 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLCQ05315 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLCQ05315 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLCQ05315 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLCQ05315 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLCQ05315 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLCQ05315 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLCQ05315 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLCQ05315 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLCQ05315 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLCQ05315 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLCQ05315 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLCQ05315 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLCQ05315 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLCQ05315 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLCQ05315 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CLCQ05315 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLCQ05315 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLCQ05315 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLCQ05315 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLCQ05315 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLCQ05315 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLCQ05315 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLCQ05315 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLCQ05315 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLCQ05315 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLCQ05315 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLCQ05315 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLCQ05315 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLCQ05315 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLCQ05315 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLCQ05315 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLCQ05315 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLCQ05315 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLCQ05315 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLCQ05315 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLCQ05315 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLCQ05315 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLCQ05315 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLCQ05315 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLCQ05315 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLCQ05315 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLCQ05315 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLCQ05315 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLCQ05315 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLCQ05315 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLCQ05315 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLCQ05315 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLCQ05315 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CLCQ05315 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLCQ05315 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLCQ05315 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLCQ05315 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLCQ05315 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLCQ05315 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLCQ05315 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLCQ05315 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLCQ05315 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLCQ05315 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLCQ05315 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLCQ05315 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLCQ05315 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLCQ05315 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLCQ05315 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLCQ05315 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLCQ05315 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CLCQ05315 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLCQ05315 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CLCQ05315 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLCQ05315 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLCQ05315 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLCQ05315 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLCQ05315 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLCQ05315 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLCQ05315 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLCQ05315 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLCQ05315 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CLCQ05315 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLCQ05315 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms