Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cacna1cQ01815 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms