Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gjb2Q00977 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Gjb2Q00977 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms