Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Stx2Q00262 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx2Q00262 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms