Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTRA4P83105 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTRA4P83105 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms