Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Stra8P70278 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Stra8P70278 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Stra8P70278 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Stra8P70278 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Stra8P70278 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Stra8P70278 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Stra8P70278 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Stra8P70278 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Stra8P70278 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Stra8P70278 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Stra8P70278 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Stra8P70278 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Stra8P70278 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Stra8P70278 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Stra8P70278 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Stra8P70278 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Stra8P70278 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Stra8P70278 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Stra8P70278 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Stra8P70278 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Stra8P70278 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Stra8P70278 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Stra8P70278 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Stra8P70278 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Stra8P70278 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Stra8P70278 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Stra8P70278 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Stra8P70278 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Stra8P70278 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Stra8P70278 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Stra8P70278 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Stra8P70278 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Stra8P70278 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Stra8P70278 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Stra8P70278 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Stra8P70278 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Stra8P70278 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms