Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HERVK_113P63132 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HERVK_113P63132 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HERVK_113P63132 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113P63132 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113P63132 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113P63132 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113P63132 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113P63132 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113P63132 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113P63132 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113P63132 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113P63132 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P63132 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P63132 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P63132 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P63132 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P63132 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P63132 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P63132 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P63132 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P63132 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P63132 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P63132 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P63132 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P63132 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P63132 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P63132 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P63132 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P63132 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P63132 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P63132 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P63132 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P63132 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P63132 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P63132 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P63132 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P63132 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P63132 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P63132 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P63132 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P63132 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P63132 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P63132 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P63132 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P63132 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P63132 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P63132 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P63132 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P63132 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P63132 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P63132 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P63132 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P63132 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P63132 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P63132 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P63132 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P63132 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P63132 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P63132 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P63132 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P63132 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P63132 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P63132 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P63132 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P63132 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P63132 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P63132 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P63132 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P63132 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P63132 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P63132 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P63132 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113P63132 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113P63132 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113P63132 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113P63132 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113P63132 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113P63132 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113P63132 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113P63132 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms