Protein–RNA interactions for Protein: P61588

Rnd3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnd3P61588 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms