Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX9P55771 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX9P55771 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX9P55771 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX9P55771 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX9P55771 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX9P55771 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX9P55771 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX9P55771 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX9P55771 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX9P55771 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX9P55771 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX9P55771 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PAX9P55771 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PAX9P55771 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PAX9P55771 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PAX9P55771 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PAX9P55771 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX9P55771 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX9P55771 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX9P55771 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX9P55771 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX9P55771 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX9P55771 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX9P55771 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX9P55771 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX9P55771 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX9P55771 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX9P55771 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX9P55771 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX9P55771 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX9P55771 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX9P55771 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX9P55771 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX9P55771 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX9P55771 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX9P55771 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX9P55771 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX9P55771 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX9P55771 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX9P55771 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX9P55771 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX9P55771 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX9P55771 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX9P55771 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX9P55771 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX9P55771 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX9P55771 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX9P55771 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX9P55771 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX9P55771 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX9P55771 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX9P55771 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX9P55771 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX9P55771 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX9P55771 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX9P55771 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAX9P55771 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAX9P55771 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAX9P55771 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAX9P55771 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAX9P55771 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAX9P55771 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PAX9P55771 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAX9P55771 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAX9P55771 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAX9P55771 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAX9P55771 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAX9P55771 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAX9P55771 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX9P55771 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX9P55771 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX9P55771 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX9P55771 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX9P55771 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX9P55771 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX9P55771 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX9P55771 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX9P55771 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX9P55771 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX9P55771 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX9P55771 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX9P55771 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX9P55771 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX9P55771 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX9P55771 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX9P55771 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX9P55771 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX9P55771 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX9P55771 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX9P55771 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX9P55771 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX9P55771 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX9P55771 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX9P55771 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAX9P55771 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAX9P55771 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAX9P55771 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAX9P55771 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAX9P55771 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms