Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CRISP3P54108 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms