Protein–RNA interactions for Protein: P50552

VASP, Vasodilator-stimulated phosphoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VASPP50552 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VASPP50552 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VASPP50552 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VASPP50552 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VASPP50552 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VASPP50552 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VASPP50552 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VASPP50552 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VASPP50552 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VASPP50552 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VASPP50552 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VASPP50552 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VASPP50552 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VASPP50552 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VASPP50552 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VASPP50552 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VASPP50552 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VASPP50552 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VASPP50552 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VASPP50552 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VASPP50552 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VASPP50552 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VASPP50552 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VASPP50552 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VASPP50552 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VASPP50552 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VASPP50552 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VASPP50552 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VASPP50552 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VASPP50552 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VASPP50552 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VASPP50552 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VASPP50552 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VASPP50552 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VASPP50552 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VASPP50552 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VASPP50552 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VASPP50552 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VASPP50552 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VASPP50552 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VASPP50552 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VASPP50552 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VASPP50552 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VASPP50552 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VASPP50552 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VASPP50552 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VASPP50552 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VASPP50552 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VASPP50552 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VASPP50552 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VASPP50552 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VASPP50552 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VASPP50552 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VASPP50552 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VASPP50552 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VASPP50552 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VASPP50552 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VASPP50552 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VASPP50552 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VASPP50552 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VASPP50552 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VASPP50552 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VASPP50552 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VASPP50552 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VASPP50552 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VASPP50552 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VASPP50552 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VASPP50552 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VASPP50552 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VASPP50552 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VASPP50552 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VASPP50552 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VASPP50552 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VASPP50552 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VASPP50552 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VASPP50552 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VASPP50552 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VASPP50552 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VASPP50552 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VASPP50552 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VASPP50552 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VASPP50552 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VASPP50552 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VASPP50552 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VASPP50552 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VASPP50552 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VASPP50552 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VASPP50552 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VASPP50552 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VASPP50552 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VASPP50552 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VASPP50552 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VASPP50552 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VASPP50552 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VASPP50552 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VASPP50552 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VASPP50552 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VASPP50552 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VASPP50552 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VASPP50552 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms