Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk5P49615 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdk5P49615 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms