Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rfc1P35601 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms