Protein–RNA interactions for Protein: P32883

Kras, GTPase KRas, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KrasP32883 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KrasP32883 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KrasP32883 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KrasP32883 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KrasP32883 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KrasP32883 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KrasP32883 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KrasP32883 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KrasP32883 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KrasP32883 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KrasP32883 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KrasP32883 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KrasP32883 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KrasP32883 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KrasP32883 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KrasP32883 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KrasP32883 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KrasP32883 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KrasP32883 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KrasP32883 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KrasP32883 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KrasP32883 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KrasP32883 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KrasP32883 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KrasP32883 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KrasP32883 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KrasP32883 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KrasP32883 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KrasP32883 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KrasP32883 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KrasP32883 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KrasP32883 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KrasP32883 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KrasP32883 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KrasP32883 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KrasP32883 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KrasP32883 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KrasP32883 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KrasP32883 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KrasP32883 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KrasP32883 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KrasP32883 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KrasP32883 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KrasP32883 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KrasP32883 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KrasP32883 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KrasP32883 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KrasP32883 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KrasP32883 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KrasP32883 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KrasP32883 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KrasP32883 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KrasP32883 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KrasP32883 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KrasP32883 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KrasP32883 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KrasP32883 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KrasP32883 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KrasP32883 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KrasP32883 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KrasP32883 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KrasP32883 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KrasP32883 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KrasP32883 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KrasP32883 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KrasP32883 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KrasP32883 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KrasP32883 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KrasP32883 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KrasP32883 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KrasP32883 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KrasP32883 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KrasP32883 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KrasP32883 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KrasP32883 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KrasP32883 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KrasP32883 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KrasP32883 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KrasP32883 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KrasP32883 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KrasP32883 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KrasP32883 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KrasP32883 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KrasP32883 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KrasP32883 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
KrasP32883 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KrasP32883 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KrasP32883 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KrasP32883 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KrasP32883 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KrasP32883 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KrasP32883 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KrasP32883 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KrasP32883 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KrasP32883 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KrasP32883 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KrasP32883 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KrasP32883 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KrasP32883 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KrasP32883 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms