Protein–RNA interactions for Protein: P30658

Cbx2, Chromobox protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx2P30658 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx2P30658 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx2P30658 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms