Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd10P28359 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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