Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Etv4P28322 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv4P28322 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv4P28322 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv4P28322 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Etv4P28322 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Etv4P28322 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Etv4P28322 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms