Protein–RNA interactions for Protein: P08775

Polr2a, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2aP08775 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Polr2aP08775 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms