Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NeflP08551 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NeflP08551 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NeflP08551 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NeflP08551 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NeflP08551 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NeflP08551 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NeflP08551 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NeflP08551 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NeflP08551 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NeflP08551 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NeflP08551 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NeflP08551 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NeflP08551 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NeflP08551 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NeflP08551 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NeflP08551 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NeflP08551 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NeflP08551 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NeflP08551 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NeflP08551 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NeflP08551 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NeflP08551 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NeflP08551 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NeflP08551 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NeflP08551 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NeflP08551 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NeflP08551 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NeflP08551 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NeflP08551 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NeflP08551 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NeflP08551 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NeflP08551 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NeflP08551 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NeflP08551 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NeflP08551 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NeflP08551 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NeflP08551 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NeflP08551 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NeflP08551 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NeflP08551 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NeflP08551 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NeflP08551 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NeflP08551 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NeflP08551 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NeflP08551 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NeflP08551 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NeflP08551 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NeflP08551 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NeflP08551 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NeflP08551 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NeflP08551 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NeflP08551 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NeflP08551 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NeflP08551 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NeflP08551 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NeflP08551 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NeflP08551 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NeflP08551 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NeflP08551 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NeflP08551 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NeflP08551 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NeflP08551 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NeflP08551 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NeflP08551 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NeflP08551 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NeflP08551 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NeflP08551 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NeflP08551 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NeflP08551 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NeflP08551 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NeflP08551 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NeflP08551 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NeflP08551 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NeflP08551 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NeflP08551 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NeflP08551 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NeflP08551 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NeflP08551 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NeflP08551 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NeflP08551 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NeflP08551 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NeflP08551 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NeflP08551 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NeflP08551 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NeflP08551 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NeflP08551 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NeflP08551 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NeflP08551 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NeflP08551 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NeflP08551 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NeflP08551 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NeflP08551 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NeflP08551 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NeflP08551 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NeflP08551 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NeflP08551 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NeflP08551 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NeflP08551 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NeflP08551 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms