Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
P04214 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
P04214 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
P04214 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
P04214 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
P04214 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
P04214 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
P04214 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
P04214 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
P04214 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
P04214 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
P04214 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
P04214 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
P04214 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P04214 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P04214 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
P04214 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P04214 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P04214 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P04214 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
P04214 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P04214 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
P04214 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
P04214 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P04214 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P04214 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P04214 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
P04214 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P04214 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P04214 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P04214 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P04214 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P04214 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
P04214 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P04214 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P04214 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P04214 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P04214 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P04214 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P04214 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
P04214 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P04214 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P04214 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
P04214 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P04214 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P04214 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P04214 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P04214 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
P04214 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P04214 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P04214 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
P04214 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P04214 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P04214 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
P04214 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
P04214 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P04214 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P04214 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P04214 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
P04214 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P04214 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P04214 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P04214 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P04214 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P04214 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P04214 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P04214 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
P04214 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P04214 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P04214 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P04214 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P04214 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P04214 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
P04214 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P04214 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P04214 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P04214 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P04214 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P04214 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P04214 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P04214 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P04214 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P04214 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P04214 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P04214 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P04214 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P04214 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P04214 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P04214 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P04214 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P04214 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P04214 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P04214 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P04214 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P04214 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P04214 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P04214 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
P04214 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P04214 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P04214 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms