Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms