Protein–RNA interactions for Protein: P01665

Ig kappa chain V-III region PC 7043, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01665 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P01665 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P01665 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
P01665 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P01665 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P01665 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P01665 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P01665 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P01665 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P01665 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
P01665 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
P01665 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01665 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01665 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
P01665 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01665 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01665 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01665 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01665 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01665 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01665 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01665 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01665 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01665 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01665 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01665 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01665 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01665 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01665 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
P01665 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
P01665 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
P01665 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
P01665 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
P01665 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01665 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01665 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01665 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01665 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01665 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01665 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01665 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01665 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01665 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01665 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01665 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01665 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01665 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01665 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01665 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01665 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01665 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01665 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01665 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01665 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01665 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01665 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01665 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01665 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01665 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01665 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01665 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01665 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01665 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01665 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01665 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01665 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01665 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01665 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01665 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01665 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
P01665 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
P01665 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01665 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01665 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01665 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01665 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01665 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01665 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01665 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01665 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01665 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01665 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01665 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
P01665 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01665 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01665 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01665 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01665 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01665 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01665 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01665 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
P01665 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01665 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01665 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01665 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01665 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01665 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01665 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01665 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01665 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms