Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfibp2O35711 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms