Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ARVCFO00192 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms