Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8050L7N2E3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8050L7N2E3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms