Protein–RNA interactions for Protein: L7N219

Gm5458, Predicted gene 5458, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5458L7N219 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm5458L7N219 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5458L7N219 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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