Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700014D04RikJ3QMS2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700014D04RikJ3QMS2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms