Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
Urb2E9Q7L1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Urb2E9Q7L1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Urb2E9Q7L1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Urb2E9Q7L1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Urb2E9Q7L1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Urb2E9Q7L1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Urb2E9Q7L1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Urb2E9Q7L1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Urb2E9Q7L1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Urb2E9Q7L1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Urb2E9Q7L1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Urb2E9Q7L1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Urb2E9Q7L1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Urb2E9Q7L1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Urb2E9Q7L1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Urb2E9Q7L1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Urb2E9Q7L1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Urb2E9Q7L1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Urb2E9Q7L1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Urb2E9Q7L1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Urb2E9Q7L1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Urb2E9Q7L1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Urb2E9Q7L1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Urb2E9Q7L1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Urb2E9Q7L1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Urb2E9Q7L1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Urb2E9Q7L1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Urb2E9Q7L1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Urb2E9Q7L1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Urb2E9Q7L1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Urb2E9Q7L1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Urb2E9Q7L1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Urb2E9Q7L1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Urb2E9Q7L1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms