Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Pdzd2E9Q1M1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Pdzd2E9Q1M1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Pdzd2E9Q1M1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Pdzd2E9Q1M1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Pdzd2E9Q1M1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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