Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Zfp558E9Q1J0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Zfp558E9Q1J0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Zfp558E9Q1J0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Zfp558E9Q1J0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Zfp558E9Q1J0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Zfp558E9Q1J0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Zfp558E9Q1J0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
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Zfp558E9Q1J0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
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Zfp558E9Q1J0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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