Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms