Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AU015836B2RUM3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms