Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprsB0V2N1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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PtprsB0V2N1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprsB0V2N1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms