Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMB4A4D0S4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms