Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc183A2AJB1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms