Protein–RNA interactions for Protein: A2A825

Rsg1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsg1A2A825 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsg1A2A825 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rsg1A2A825 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms