Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RfxankQ9Z205 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms