Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z101

Pard6a, Partitioning defective 6 homolog alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6aQ9Z101 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pard6aQ9Z101 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms