Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K2

SIK3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK3Q9Y2K2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SIK3Q9Y2K2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIK3Q9Y2K2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms