Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ntn3Q9R1A3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms