Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Copg1Q9QZE5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Copg1Q9QZE5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Copg1Q9QZE5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Copg1Q9QZE5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Copg1Q9QZE5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Copg1Q9QZE5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Copg1Q9QZE5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Copg1Q9QZE5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Copg1Q9QZE5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Copg1Q9QZE5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Copg1Q9QZE5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Copg1Q9QZE5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Copg1Q9QZE5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Copg1Q9QZE5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Copg1Q9QZE5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Copg1Q9QZE5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Copg1Q9QZE5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Copg1Q9QZE5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Copg1Q9QZE5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Copg1Q9QZE5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Copg1Q9QZE5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Copg1Q9QZE5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Copg1Q9QZE5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Copg1Q9QZE5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Copg1Q9QZE5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Copg1Q9QZE5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Copg1Q9QZE5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Copg1Q9QZE5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms