Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bcl11aQ9QYE3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bcl11aQ9QYE3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bcl11aQ9QYE3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bcl11aQ9QYE3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bcl11aQ9QYE3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Bcl11aQ9QYE3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms