Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trim44Q9QXA7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms