Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMEM248Q9NWD8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM248Q9NWD8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM248Q9NWD8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms